Следователь Кусанаги из полиции Токио берётся за необъяснимые преступления и просит помощи у друга, физика Манабу Юкавы по прозвищу Галилей. Тот ищет научные объяснения там, где расследование заходит в тупик, и проверяет всё, что кажется невероятным. Позже герои сталкиваются с делами, где фигурируют призраки и мстительные духи — и поиск ответов ставит под угрозу их дружбу. Затем следователь приносит физику дело о бытовом убийстве: подозреваемая уже есть, но детали никак не сходятся. По мере расследования поиск истины становится интеллектуальным противоборством.